Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms