Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Lrrc43Q3V0L5 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrc43Q3V0L5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Lrrc43Q3V0L5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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Lrrc43Q3V0L5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Lrrc43Q3V0L5 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Lrrc43Q3V0L5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Lrrc43Q3V0L5 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1120-201ENSMUST00000058737 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Lrrc43Q3V0L5 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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