Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm2788-206ENSMUST00000210463 1338 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms