Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pde1bQ01065 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280 ms