Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc183A2AJB1 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc183A2AJB1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms