Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 2810403D21Rik-204ENSMUST00000144421 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NischQ80TM9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NischQ80TM9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
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