Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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D13Ertd608eQ3UPR8 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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D13Ertd608eQ3UPR8 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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D13Ertd608eQ3UPR8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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D13Ertd608eQ3UPR8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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D13Ertd608eQ3UPR8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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