Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
PtprbB2RU80 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprbB2RU80 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprbB2RU80 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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PtprbB2RU80 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PtprbB2RU80 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms