Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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