Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cib2Q9Z309 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib2Q9Z309 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms