Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc22a4Q9Z306 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc22a4Q9Z306 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a4Q9Z306 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms