Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cyp46a1Q9WVK8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp46a1Q9WVK8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms