Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp1a4Q9WV27 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp1a4Q9WV27 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp1a4Q9WV27 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms