Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnip1Q9WUU8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnip1Q9WUU8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnip1Q9WUU8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms