Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pus1Q9WU56 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pus1Q9WU56 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms