Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ggps1Q9WTN0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ggps1Q9WTN0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ggps1Q9WTN0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms