Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZMYND8Q9ULU4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZMYND8Q9ULU4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms