Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copg1Q9QZE5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copg1Q9QZE5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copg1Q9QZE5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms