Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vps29Q9QZ88 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vps29Q9QZ88 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms