Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hacd1Q9QY80 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hacd1Q9QY80 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms