Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PARD6AQ9NPB6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PARD6AQ9NPB6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PARD6AQ9NPB6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms