Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hdgfl3Q9JMG7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms