Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Habp4Q9JKS5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Habp4Q9JKS5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 721.7 ms