Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nova1Q9JKN6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nova1Q9JKN6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms