Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Alyref2Q9JJW6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Alyref2Q9JJW6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms