Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpf2Q9JJ80 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms