Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmbr1Q9JIT0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmbr1Q9JIT0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms