Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod3Q9JHJ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod3Q9JHJ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod3Q9JHJ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod3Q9JHJ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmod3Q9JHJ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod3Q9JHJ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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