Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Exosc9Q9JHI7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Exosc9Q9JHI7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Exosc9Q9JHI7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms