Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim54Q9ERP3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim54Q9ERP3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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