Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms