Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ap3s1Q9DCR2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap3s1Q9DCR2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 321.1 ms