Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Smg9Q9DB90 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Smg9Q9DB90 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Smg9Q9DB90 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Smg9Q9DB90 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Smg9Q9DB90 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smg9Q9DB90 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms