Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scp2d1Q9DAH1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scp2d1Q9DAH1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 349.1 ms