Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem239Q9DA47 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmem239Q9DA47 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmem239Q9DA47 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmem239Q9DA47 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem239Q9DA47 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem239Q9DA47 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tmem239Q9DA47 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tmem239Q9DA47 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem239Q9DA47 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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