Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9W1

Pifo, Protein pitchfork, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PifoQ9D9W1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PifoQ9D9W1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PifoQ9D9W1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PifoQ9D9W1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PifoQ9D9W1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms