Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc70Q9D9B0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc70Q9D9B0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc70Q9D9B0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc70Q9D9B0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc70Q9D9B0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc70Q9D9B0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc70Q9D9B0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc70Q9D9B0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms