Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vstm5Q9D806 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vstm5Q9D806 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms