Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chmp4cQ9D7F7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chmp4cQ9D7F7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp4cQ9D7F7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms