Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Srp19Q9D7A6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Srp19Q9D7A6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Srp19Q9D7A6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Srp19Q9D7A6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Srp19Q9D7A6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Srp19Q9D7A6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Srp19Q9D7A6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Srp19Q9D7A6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Srp19Q9D7A6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Srp19Q9D7A6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Srp19Q9D7A6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srp19Q9D7A6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms