Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ptp4a3Q9D658 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ptp4a3Q9D658 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptp4a3Q9D658 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms