Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tssk3Q9D2E1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tssk3Q9D2E1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tssk3Q9D2E1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms