Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Necap2Q9D1J1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms