Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem53Q9D0Z3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tmem53Q9D0Z3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms