Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssbp2Q9CYZ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp2Q9CYZ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms