Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lhfpl3Q9CTN8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms