Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRW3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CRW3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CRW3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRW3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRW3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CRW3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms