Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700029F12RikQ9CRB4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029F12RikQ9CRB4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms