Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg12Q9CQY1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg12Q9CQY1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg12Q9CQY1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms