Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RTRAFQ9CQE8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTRAFQ9CQE8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms